PAINEL GENETICO, PARA SÍNDROMES DE FALÊNCIA MEDULAR, Vários Materiais

Orientações do cliente

"I - Preparo

Amostra de sangue: Não é necessário preparo

Amostras de saliva ou swab: 30 minutos antes da coleta, não beber, comer, fumar, mascar chicletes, escovar os dentes ou inserir qualquer objeto na boca.

II - Exame

• Este exame é realizado somente com solicitação médica.
• Menores de 18 anos devem estar acompanhados de um adulto responsável para a realização do exame.
• Para realizar este exame, é ideal a coleta de amostras dos genitores para fins de confirmação de segregação de variantes e de aconselhamento genético. Porém, a coleta dos genitores não é obrigatória em caso de pais falecidos, distantes ou não presentes.
• O cliente deve entregar no dia da coleta o Questionário preenchido e assinado por ele (obrigatório) e pelo médico solicitante (recomendável, porém não obrigatório).
• Esse Questionário pode ser retirado em qualquer unidade ou solicitado por e-mail para [email protected] (o e-mail será respondido em até 48h)
• Caso não seja possível ter o Questionário preenchido pelo médico solicitante, o Fleury oferece de maneira OPCIONAL a consulta de aconselhamento genético, a fim de preencher o questionário e esclarecer eventuais dúvidas do exame.
• O exame pode ser oferecido a partir de coleta de saliva ou swab. Para mais informações sobre esta opção, acesse www.fleurygenomica.com.br

Orientações necessárias

I - Preparo

Amostra de sangue: Não é necessário preparo

Amostras de saliva ou swab: 30 minutos antes da coleta, não beber, comer, fumar, mascar chicletes, escovar os dentes ou inserir qualquer objeto na boca.

II - Exame

• Este exame é realizado somente com solicitação médica.
• Menores de 18 anos devem estar acompanhados de um adulto responsável para a realização do exame.
• O cliente deve entregar no dia da coleta o Questionário preenchido e assinado por ele (obrigatório) e pelo médico solicitante (recomendável, porém não obrigatório).
• Esse Questionário pode ser retirado em qualquer unidade ou solicitado por e-mail para [email protected] (o e-mail será respondido em até 48h)
• Caso não seja possível ter o Questionário preenchido pelo médico solicitante, o Fleury oferece de maneira OPCIONAL a consulta de aconselhamento genético, a fim de preencher o questionário e esclarecer eventuais dúvidas do exame.
• O exame pode ser oferecido a partir de coleta de saliva ou e swab.

Processamento e adequação da amostra

"""Não manipular

• Se amostra colhida em EDTA, enviar o material refrigerado para setor de Métodos Moleculares acompanhado do Questionário original preenchido;
• Se a amostra colhida for saliva ou swab, enviar o material em temperatura ambiente para setor de Métodos Moleculares acompanhado do Questionário original preenchido;
• Rejeitar amostras de sangue colhidas em tubo com heparina ou qualquer tubo que não esteja de acordo com o solicitado no procedimento de coleta;

Estabilidade da amostra de sangue:

Temperatura ambiente: 72 horas;

Refrigerada (2-8 ºC): 5 dias;

Congelada (-20 ºC): não aceitável.

Estabilidade da amostra de saliva ou swab:

Temperatura ambiente: 30 dias

Refrigerada (2-8ºC): 30 dias

Congelada (-20ºC): não aceitável.

Método

Sequenciamento completo (NGS - sequenciamento de nova geração) de todas as regiões codificantes e regiões flanqueadoras adjacentes aos exons de 140 genes relacionados às síndromes de falência medular herdadas (SFMH): ABCG5, ABCG8, ACD, ACTN1, ADAMTS13, AK2, ANKRD26 (inclui região 5´UTR), AP3B1, BRCA1 (FANCS), BRCA2 (FANCD), BRIP1 (FANCJ), C3, CD40LG, CD46, CDKN2A, CFB, CFH, CFHR1, CFHR3, CFHR4, CFHR5, CFI, CLPB, CSF3R, CTC1, CXCR2, CXCR4, CYCS, DGKE, DKC1, DNAJC21, EFTUD1 (EFL1), EIF2AK3, ELANE, ERCC4 (FANCQ), ETV6, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FLI1, FLNA, FLVCR1 (AXPC1), FYB (FYB1), G6PC3, GAR1, GATA1, GATA2, GFI1, GFI1B, GP1BB, GP9, GRHL2, HAX1, HOXA11, HSP90AA1 (HSPC1, HSPCA), HYOU1, ITGA2B, JAGN1, LAMTOR2, LIG4, LYST, MAD2L2 (FANCV), MKL1, MPL, MYH9, NAF1, NBEAL2, NBN, NHP2, NOP10, OBFC1, PALB2 (FANCN), PARN, POT1, PRF1, PRKACG, RAB27A, RAC2, RAD51 (FANCR), RAD51C (FANCO), RBM8A, RFWD3 (FANCW), RMRP, RPL11, RPL15, RPL18, RPL26, RPL27, RPL31, RPL35, RPL35A, RPL5, RPS10, RPS19, RPS24, RPS26, RPS27, RPS28, RPS29, RPS7, RTEL1, RUNX1, SBDS, SLC37A4, SLFN14, SLX4 (FANCP), SMARCD2, SRC, SRP54, STK4, TAZ, TCIRG1, TCN2, TEP1, TERC, TERT (inclui região 5´UTR), THBD, TINF2, TP53, TPP1, TSR1, TSR2, TUBB1, UBE2T (FANCT), USB1, VPS13B, VPS45, VWF, WAS, WDR1, WIPF1, WRAP53 e XRCC2 (FANCU). Este ensaio permite a identificação de variantes de nucleotídeo único (SNVs), pequenas inserções e deleções (INDELS), bem como variações no número de cópias (CNVs) que compreendam três ou mais exons dos genes estudados e NÃO inclui análise por MLPA. É realizada análise criteriosa em busca de variantes genéticas patogênicas/provavelmente patogênicas. Variantes benignas/provavelmente benignas não serão reportadas. O ensaio fornece o perfil de mutações e o percentual de apresentação das variantes. A interpretação dos achados é fornecida com base na presença de variantes patogênicas ou provavelmente patogênicas.

Interpretação e comentários

As síndromes de falência medular herdadas (SFMH) compreendem diversas doenças, como trombocitopenia amegacariocítica congênita (gene MPL), anemia de Fanconi, síndrome de Shwachman-Diamond, neutropenia congênita grave (ELANE) ou síndrome de Kostmann (HAX1, G6PC3, GFI1 e WAS), dentre outras.

Graças aos avanços na pesquisa genômica foi possível ampliar o conhecimento das mutações presentes nesse conjunto moléstias. Já se sabia que a anemia de Fanconi (ocasionada por lesões germinativas em 22 genes) predispõe a neoplasias mieloides (NM). Porém, mais recentemente, evidenciou-se que pacientes com história pessoal ou familiar de citopenias isoladas, bicito ou pancitopenia, sem causa aparente, podem apresentar mutações germinativas e, eventualmente, evoluir para neoplasia hematopoética (NH, leucemias mieloide aguda e linfoblástica aguda, neoplasia mielodisplástica, neoplasia mieloproliferativa e neoplasia mieloproliferativa/mielodisplásica (NMP/SMD). Nesse grupo de síndromes de predisposição a NM encontram-se a deficiência de GATA2, mutações em RUNX1, SAMD9/9l, etc.

A 5ª edição da Classificação da OMS para os tumores hematolinfoides incorpora detalhes para a definição de subtipos de neoplasias associadas a predisposição germinativa (Khoury et al, 2022). Para tanto há uma fórmula de abordagem que relaciona o fenótipo mieloide com o genótipo germinativo predisponente. Deve-se suspeitar-se de predisposição germinativa quando houver: história individual de múltiplos tumores; trombocitopenia e macrocitose precedendo por anos o diagnóstico de NH; familiar de primeiro ou segundo grau com tumores sólidos relacionados à predisposição germinativa (Ex. câncer da mama antes dos 50 anos); familiar de primeiro ou segundo grau com NH; e presença de dismorfismo e disfunções orgânicas.

A região 5´UTR dos genes ANKRD26 e TERC e o gene RMPR não atingem cobertura horizontal de todas as suas regiões. As variantes previamente relatadas como patogênicas e/ou provavelmente patogênicas (Clinvar) se encontram nessa região de cobertura, portanto podem ser identificadas pelo teste (consulta realizada em 24/08/2022). Entretanto, eventuais mutações fora dessa região não serão detectadas.